2006年12月28日，学校第19次党委会研究决定，成立新区建设指挥部。2007年9月27日，学校第31次校党委会研究决定，对新校区建设指挥部领导班子进行了调整。
一、指挥部领导班子成员组成
　　指 挥 长：祁俊生（学校党委委员、副校长）
　　副指挥长：陈文昆（学校党委委员、纪委书记）
　　崔广平（学校党委委员、党委组织部长）
二、指挥部下设机构及负责人
　　1、办公室
　　主任：曹江陵
　　助理：刘亚涛（兼） 黄东东（法律顾问）
　　2、工程招投标部
　　主 任：蒲晓东
　　副主任：胡均国
　　3、工程部
　　主任：牟伦祥
　　助理：刘亚涛
　　4、物资采购部
　　主 任：高奇
　　副主任：涂辉
　　5、财务部
　　主任：蒋念生
　　6、保卫部
　　主任：张新海
　　7、纪检组
　　组长：邓发权
　　助理：叶晋国
　　8、总工办